ij3d.utils
Class TabUtil

java.lang.Object
  ij3d.utils.TabUtil

public class TabUtil
extends java.lang.Object

classe permettant :
le stockage d'un tableau de float les calculs statistiques sur ce tableau le tri du tableau

Author:

Cedric MESSAOUDI & Thomas BOUDIER

Constructor Summary

TabUtil(float[] data)
constructeur

TabUtil(int size)
constructeur

Method Summary

boolean	addValue(int position, float value) Adds a value at a index
void	concat(TabUtil tabToAdd) concat an array to the end
boolean	contient(int val) Le tableau contient-il cette valeur
boolean	contientQue(int val) test if array has only a particular value
float	convolve(float[] kernel, float D) Convolution with a kernel
TabUtil	distinctValues()
void	draw(int scale) drawing of the array as an image
static double[]	fitGaussian(double[] values, int maxR)
float[]	getArray() Gets the array attribute of the TabUtil object
TabUtil	getCopy() Gets the copy attribute of the TabUtil object
int	getLimitInf(int th) Gets the index of the first non zero value
int	getLimitSup() Dernier indice de valeur non nulle
float	getMaximum() recupere la valeur maximum du tableau
float	getMean() calcule la moyenne du tableau
float	getMinimum() recupere la valeur minimum
float	getMinimumAbove(float th) Gets the minimum value above a threshold
float	getSigma() calcul l'ecart-type du tableau
int	getSize() recupere la taille du tableau
TabUtil	getSubTabUtil(int startindex, int newsize) extract a sub-array from this array
float	getSum() calcule la somme du tableau
float	getValue(int position) recupere la valeur d'une position donnee
float	getVariance()
int	indexOfSumPercent(double percent) calcul l'index du tableau correspondant au pourcentage donne il calcule le total des valeurs ensuite il additionne au fur et a mesure et compare à percent*total si la somme est superieure il retourne l'index ou il est.
boolean	isEqual(TabUtil other) test if two arrays are identical
boolean	isEqual(TabUtil other, int begin, int end) test if two arrays are identical between two indexes
TabUtil	lissage(int vois) lisse le tableau selon un voisinage (le tableau lui-meme n'est pas modifie)
float	median() Find median.
float	median2() recupere la valeur mediane du tableau
void	melange() random mix of the values
int	moyenneIntermediaire() isodata algorithm (for histogram)
boolean	putValue(int position, float value) met une valeur a la position donnee
void	putValues(TabUtil tmp) put values inside an array
void	removeValueAt(int index) remove a value at a position
void	setSize(int size) impose une nouvelle taille au tableau
void	sort() trie le tableau selon l'algorithme Shell-Meitzner
int[]	sortIndex() trie le tableau selon l'algorithme Shell-Meitzner
java.lang.String	toString() information to be displayed

Methods inherited from class java.lang.Object

clone, equals, finalize, getClass, hashCode, notify, notifyAll, wait, wait, wait

Constructor Detail

TabUtil

public TabUtil(int size)

constructeur

Parameters:

size - taille du tableau

TabUtil

public TabUtil(float[] data)

constructeur

Parameters:

data - tableau de float

Method Detail

putValue

public boolean putValue(int position,
                        float value)

met une valeur a la position donnee

Parameters:

position - position dans le tableau

value - valeur a mettre

Returns:

faux s'il y a une erreur(position n'existant pas)

getValue

public float getValue(int position)

recupere la valeur d'une position donnee

Parameters:

position - position dont on veut recuperer la valeur

Returns:

la valeur de la position

getSize

public int getSize()

recupere la taille du tableau

Returns:

la taille du tableau

getArray

public float[] getArray()

Gets the array attribute of the TabUtil object

Returns:

The array value

setSize

public void setSize(int size)

impose une nouvelle taille au tableau

Parameters:

size - The new size value

getMaximum

public float getMaximum()

recupere la valeur maximum du tableau

Returns:

la valeur maximum contenue dans le tableau

getLimitSup

public int getLimitSup()

Dernier indice de valeur non nulle

Returns:

The limitSup value

getLimitInf

public int getLimitInf(int th)

Gets the index of the first non zero value

Parameters:

th - minimum index

Returns:

The limitInf value

getMinimum

public float getMinimum()

recupere la valeur minimum

Returns:

la valeur minimum contenue dans le tableau

getMinimumAbove

public float getMinimumAbove(float th)

Gets the minimum value above a threshold

Parameters:

th - the threshold

Returns:

The minimumAbove value

getMean

public float getMean()

calcule la moyenne du tableau

Returns:

la moyenne des valeurs du tableau

getSum

public float getSum()

calcule la somme du tableau

Returns:

la somme des valeurs du tableau

getSigma

public float getSigma()

calcul l'ecart-type du tableau

Returns:

l'ecart-type des valeurs du tableau

getVariance

public float getVariance()

Returns:

distinctValues

public TabUtil distinctValues()

Returns:

lissage

public TabUtil lissage(int vois)

lisse le tableau selon un voisinage (le tableau lui-meme n'est pas modifie)

Parameters:

vois - voisinage de lissage

Returns:

un tableau avec les valeurs lissee

addValue

public boolean addValue(int position,
                        float value)

Adds a value at a index

Parameters:

position - the position index

value - the value to add

Returns:

true if position < size

sort

public void sort()

trie le tableau selon l'algorithme Shell-Meitzner

sortIndex

public int[] sortIndex()

trie le tableau selon l'algorithme Shell-Meitzner

Returns:

the sorted index

median2

public float median2()

recupere la valeur mediane du tableau

Returns:

valeur mediane du tableau

median

public float median()

Find median. Modified algorithm according to http://www.geocities.com/zabrodskyvlada/3alg.html Contributed by HeinzKlar. (copied form ij.plugin.filter.rankfilters

Returns:

Median value

convolve

public float convolve(float[] kernel,
                      float D)

Convolution with a kernel

Parameters:

kernel - the kernel

D - the divisor

Returns:

the convolvec value

indexOfSumPercent

public int indexOfSumPercent(double percent)

calcul l'index du tableau correspondant au pourcentage donne
il calcule le total des valeurs
ensuite il additionne au fur et a mesure et compare à percent*total
si la somme est superieure il retourne l'index ou il est.

Parameters:

percent - pourcentage voulu (100%=1.0 ; 50%=0.5....)

Returns:

l'index du tableau correspondant au pourcentage

contient

public boolean contient(int val)

Le tableau contient-il cette valeur

Parameters:

val - valeur

Returns:

contient ou non cette valeur

contientQue

public boolean contientQue(int val)

test if array has only a particular value

Parameters:

val - the value

Returns:

true if only this value inside the array

moyenneIntermediaire

public int moyenneIntermediaire()

isodata algorithm (for histogram)

Returns:

the computed isodata value

draw

public void draw(int scale)

drawing of the array as an image

Parameters:

scale - scale value

melange

public void melange()

random mix of the values

putValues

public void putValues(TabUtil tmp)

put values inside an array

Parameters:

tmp - the array of values to put

isEqual

public boolean isEqual(TabUtil other)

test if two arrays are identical

Parameters:

other - the other array

Returns:

true if arrays are equal

isEqual

public boolean isEqual(TabUtil other,
                       int begin,
                       int end)

test if two arrays are identical between two indexes

Parameters:

other - the other array

begin - start index

end - end index

Returns:

The equal value

getCopy

public TabUtil getCopy()

Gets the copy attribute of the TabUtil object

Returns:

The copy value

toString

public java.lang.String toString()

information to be displayed

Overrides:

toString in class java.lang.Object

Returns:

text

removeValueAt

public void removeValueAt(int index)

remove a value at a position

Parameters:

index - the position index

concat

public void concat(TabUtil tabToAdd)

concat an array to the end

Parameters:

tabToAdd - the array to concat

getSubTabUtil

public TabUtil getSubTabUtil(int startindex,
                             int newsize)

extract a sub-array from this array

Parameters:

startindex - start index

newsize - new size

Returns:

The subTabUtil value

fitGaussian

public static double[] fitGaussian(double[] values,
                                   int maxR)

Parameters:

values -

maxR -

Returns: