Uses of Class
ij3d.image3d.Image3D

Packages that use Image3D
ij3d.geom   
ij3d.image3d   
 

Uses of Image3D in ij3d.geom
 

Methods in ij3d.geom that return Image3D
 Image3D ObjectCreator3D.getImage3D()
          Gets the image3D attribute of the ObjectCreator3D object
 

Methods in ij3d.geom with parameters of type Image3D
 void Object3D.computeMassCenter(Image3D ima)
          compute mass center with an image
 double Object3D.getIntegratedDensity(Image3D ima)
          integrated density of the Object3D
 double Object3D.getMassCenterX(Image3D ima)
          x coordinate of the center
 double Object3D.getMassCenterY(Image3D ima)
          y coordinate of the center
 double Object3D.getMassCenterZ(Image3D ima)
          z coordinate of the center
 double Object3D.getMeanPixValue(Image3D ima)
          Gets the meanPixValue attribute of the Object3D object
 Pixel3D Object3D.getPixelMax(Image3D ima)
           
 double Object3D.getPixMaxValue(Image3D ima)
          Gets the pixMaxValue attribute of the Object3D object
 double Object3D.getPixMinValue(Image3D ima)
          Gets the pixMinValue attribute of the Object3D object
 double Object3D.getSigmaPixValue(Image3D ima)
          Gets the sigmaPixValue attribute of the Object3D object
 java.util.ArrayList Object3D.listVoxels(Image3D ima)
           
 

Uses of Image3D in ij3d.image3d
 

Subclasses of Image3D in ij3d.image3d
 class FHTImage3D
          Description of the Class
 class IntImage3D
          3D images with integer values (8 or 16 bits)
 class RealImage3D
          Description of the Class
 

Methods in ij3d.image3d that return Image3D
 Image3D IntImage3D.add(int s)
          Description of the Method
 Image3D RealImage3D.addImage(Image3D img, float s, float t)
          Adds a feature to the Image attribute of the RealImage3D object
 Image3D IntImage3D.addImage(IntImage3D img, float s)
          Adds a feature to the Image attribute of the IntImage3D object
 Image3D RealImage3D.addImage(RealImage3D img, float t)
          Adds a feature to the Image attribute of the RealImage3D object
abstract  Image3D Image3D.createLocalMaximaImage(int voisx, int voisy, int voisz, boolean keep)
          Création d'une image des maxima locaux dans un voisinage donne
 Image3D Image3D.crop(int newzerox, int newzeroy, int newzeroz, int newsizex, int newsizey, int newsizez)
          Description of the Method
 Image3D RealImage3D.dilatation3D(int fond, int voisx, int voisy, int voisz)
          base pour la morphologie mathématique binaire (dilatation)
Les objets sont segmentes et ont donc une couleur différente du fond
 Image3D RealImage3D.erosion3D(int fond, int voisx, int voisy, int voisz)
          Description of the Method
 Image3D Image3D.extract(int x0, int y0, int z0, int rx, int ry, int rz, boolean sphere)
          extract a 3D image from a specified location as the center of crop
 Image3D RealImage3D.fermeture3D(int fond, int voisx, int voisy, int voisz, int ite)
          Description of the Method
 Image3D RealImage3D.medianFilter(int voisx, int voisy, int voisz)
          filtre le volume grace a un filtre median 3D
 Image3D RealImage3D.minimumFilter(int voisx, int voisy, int voisz)
          filtre le volume grace a un filtre minimum 3D
 Image3D RealImage3D.nonLinearLaplacianFilter(int voisx, int voisy, int voisz)
          filtre le volume grace a un filtre laplacien non lineaire
 Image3D RealImage3D.ouverture3D(int fond, int voisx, int voisy, int voisz, int ite)
          Description of the Method
 Image3D[] Image3D.split(int axis, int nb, int overlap)
          Split a image into sub images
 Image3D RealImage3D.tophatFilter(int voisx, int voisy, int voisz)
          filtre le volume grace a un filtre top hat
 

Methods in ij3d.image3d with parameters of type Image3D
 Image3D RealImage3D.addImage(Image3D img, float s, float t)
          Adds a feature to the Image attribute of the RealImage3D object
static ij.ImageStack FHTImage3D.crossCorrelation(Image3D img1, Image3D img2)
          Cross Correlation 3D on Image3D
 IntImage3D IntImage3D.dilatation3D(Image3D ker)
          Dilatation binaire 3D avec kernel, normalement les objets sont noir sur fond blanc
 IntImage3D IntImage3D.dilatation3D(Image3D ker, boolean normal)
          Dilatation binaire 3D avec kernel, normalement les objets sont noir sur fond blanc
 IntImage3D IntImage3D.erosion3D(Image3D ker)
          Erosion binaire 3D avec kernel, normalement les objets sont noir sur fond blanc
 IntImage3D IntImage3D.erosion3D(Image3D ker, boolean normal)
          Erosion binaire 3D avec kernel, normalement les objets sont noir sur fond blanc
 IntImage3D IntImage3D.fermeture3D(Image3D ker, int ite)
          Fermeture binaire 3D avec kernel, normalement les objets sont noir sur fond blanc
 IntImage3D IntImage3D.fermeture3D(Image3D ker, int ite, boolean normal)
          Fermeture binaire 3D avec kernel, normalement les objets sont noir sur fond blanc
static Pixel3D FHTImage3D.getMaxCorrelation(Image3D img1, Image3D img2)
          Gets the maxCorrelation attribute of the FHTImage3D class
static Pixel3D FHTImage3D.getMaxCorrelation(Image3D img1, Image3D img2, int RmaxX, int RmaxY, int RmaxZ)
          Gets the maxCorrelation attribute of the FHTImage3D class
 TabUtil Image3D.getNeighborhood(Image3D ker, int x, int y, int z)
          Gets the neighboring of a pixel, with a kernel
 void Image3D.insert(Image3D vol, int x0, int y0, int z0, boolean moy)
          Insert a 3D image to a specified location
 RealImage3D RealImage3D.multiplyBy(Image3D mult)
           
 IntImage3D IntImage3D.ouverture3D(Image3D ker, int ite)
          Ouverture binaire 3D avec kernel, normalement les objets sont noir sur fond blanc
 IntImage3D IntImage3D.ouverture3D(Image3D ker, int ite, boolean normal)
          Ouverture binaire 3D avec kernel, normalement les objets sont noir sur fond blanc
static FHTImage3D FHTImage3D.Xcorr(Image3D img1, Image3D img2)
          Description of the Method
 

Constructors in ij3d.image3d with parameters of type Image3D
FHTImage3D(Image3D img)
          Constructor for the FHTImage3D object
FHTImage3D(Image3D img, boolean doTransform)
          Constructor for the FHTImage3D object
RealImage3D(Image3D img2copy)
          Constructor copying data from another RealImage3D